Metody obrazowania komórek i tkanek roślinnych Kierunek studiów: Biologia
Kod programu: W2-S1BI19.2020

Nazwa modułu: Metody obrazowania komórek i tkanek roślinnych
Kod modułu: 1BL_81a
Kod programu: W2-S1BI19.2020
Semestr: semestr zimowy 2022/2023
Język wykładowy: polski
Forma zaliczenia: zaliczenie
Punkty ECTS: 2
Opis:
Metody obrazowania komórek in vivo i in vitro to intensywnie rozwijająca się dziedzina badawcza mająca zastosowanie w biologii, biotechnologii i medycynie. Umiejętności obrazowania komórek i tkanek to podstawa we współczesnej diagnostyce związanej zarówno z analizą podstawowych procesów zachodzących w komórkach, jak i ich reakcji na stres biotyczny jak i abiotyczny. W związku z tym idea tego przedmiotu zasadza się na omówieniu metod mikroskopowych (mikroskopia świetlna i elektronowa) w obrazowaniu komórek i tkanek roślinnych, jednak co najważniejsze na pozyskaniu przez studenta praktycznych umiejętności obrazowania komórek. Celem przedmiotu jest uzyskanie przez studenta: (1) praktycznych umiejętności wykonywania obrazowania komórek z wykorzystaniem mikroskopii fluorescencyjnej, w tym konfokalnej, (2) praktycznych umiejętności akwizycji obrazu w 3 wymiarach, (3) poznanie podstaw mikrodysekcji (izolacji wyciętego materiału, izolacja pojedynczych komórek lub fragmentów tkanek z preparatów trwałych, (4) przygotowanie materiału roślinnego do obserwacji w mikroskopie fluorescencyjnym i konfokalnym (w tym immunoznakowanie) (5) zastosowanie technik dekonwolucyjnych, (6) obrazowanie komórek w mikroskopie świetlnym, konfokalnym i elektronowym (7) morfometryczna analiza obrazu, (8) analiza ekspresji genów i białek, (9) nabycie kompetencji w zakresie samodzielnego wykonywania obrazowania komórek i interpretacji uzyskanych wyników.
Wymagania wstępne:
Ogólna wiedza i umiejętności z zakresu nauk ścisłych i przyrodniczych.
Literatura podstawowa:
jak w sylabusie.
Efekt modułowy Kody efektów kierunkowych do których odnosi się efekt modułowy [stopień realizacji: skala 1-5]
Ma wiedzę dotyczącą podstawowych praw fizyki i chemii niezbędnych dla zrozumienia procesów pozwalających na wizualizację komórek i tkanek roślinnych. [1BL_81_1]
 1BL_W02_P [4/5]
Zna i rozumie budowę i funkcjonowanie organizmów na każdym poziomie komórkowym i tkankowym oraz rozumie zależności i wpływ środowiska na funkcjonowanie roślin. [1BL_81_2]
 1BL_W03_P [4/5]
Zna i rozumie metodologię badań biologicznych doświadczalnych pozwalających na wizualizacje komórek roślinnych, w szczególności zaawansowanych metod mikroskopii konfokalnej i programów komputerowych. [1BL_81_3]
 1BL_W06_P [4/5]
Rozumie związki między osiągnięciami nauk przyrodniczych, w tym technik mikroskopowych a możliwościami ich wykorzystania w życiu społeczno-gospodarczym. [1BL_81_4]
 1BL_W07_P [5/5]
Potrafi stosować podstawowe techniki i narzędzia badawcze biologii doświadczalnej, w szczególności zaawansowanych technik mikroskopowych oraz metod pozwalających na obrazowanie komórek roślinnych. [1BL_81_5]
 1BL_U01_P [5/5]
Potrafi planować i wykonywać w laboratorium proste pomiary fizyczne, biologiczne i chemiczne oraz dokonywać odpowiednich obserwacji. [1BL_81_6]
 1BL_U03_P [5/5]
Potrafi pracować samodzielnej oraz komunikować się z grupą podczas pracy zespołowej. [1BL_81_7]
 1BL_U04_P [5/5]
Typ Opis Kody efektów modułowych do których odnosi się sposób weryfikacji
zaliczenie na ocenę [1BL_81_w_1]
na zasadach określonych w sylabusie
 1BL_81_1 1BL_81_2 1BL_81_3 1BL_81_4 1BL_81_5 1BL_81_6 1BL_81_7
Rodzaj prowadzonych zajęć Praca własna studenta Sposoby weryfikacji
Typ Opis (z uwzględnieniem metod dydaktycznych) Liczba godzin Opis Liczba godzin
laboratorium [1BL_81_fs_1]
Praca pod kierunkiem prowadzącego – nabycie praktycznych umiejętności obrazowania komórek w mikroskopie fluorescencyjnym, w tym konfokalnym, analizy elektronogramów, wykonywania rekonstrukcji 3D, analizy wyników i ich interpretacji.
 30
Przygotowanie do laboratoriów na podstawie zalecanej przez prowadzącego literatury.
 20 zaliczenie na ocenę [1BL_81_w_1]
Załączniki
Opis modułu (PDF)
Informacje o sylabusach mogą ulec zmianie w trakcie trwania studiów.
Sylabusy (USOSweb)
Semestr Moduł Język wykładowy
(brak danych)