Modelowanie komputerowe Kierunek studiów: Biofizyka
Kod programu: 03-S2BF13.2017

Nazwa modułu: Modelowanie komputerowe
Kod modułu: 0305-2BF-17-03
Kod programu: 03-S2BF13.2017
Semestr:
  • semestr letni 2018/2019
  • semestr zimowy 2018/2019
  • semestr letni 2017/2018
  • semestr zimowy 2017/2018
Język wykładowy: polski
Forma zaliczenia: zaliczenie
Punkty ECTS: 4
Opis:
1. Modelowanie deterministyczne za pomocą równań różniczkowych zwyczajnych - przykłady i zastosowania w biofizyce: - modelowanie transmisji impulsów nerwowych - modelowanie wzrostu guza nowotworowego - modelowanie motorów molekularnych - wykorzystanie baz danych białek i aminokwasów 2. Teoria funkcjonału gęstości - modelowanie molekuł organicznych (np. aminokwasów) oraz wyznaczanie przy użyciu teorii DFT parametrów, które później można użyć w metodach symulacji opartych o dynamikę molekularną 3. Modelowanie molekuł organicznych metodami dynamiki molekularnej 4. Modelowanie układu optycznego oka (soczewka, rogówka, ciało szkliste, ciecz wodnista) oraz wpływ ośrodków optycznych na obraz tworzony na siatkówce oka. 5. Modelowanie wpływu soczewek stosowanych przed okiem na obraz tworzony na siatkówce oka. 6. Modelowania układów optycznych w zakresie projektowania spersonalizowanej korekcji terapeutycznej (soczewek wewnątrzgałkowych), poprzez zastosowanie algorytmów obliczeniowych.
Wymagania wstępne:
Wiedza z wykładów „Wybrane elementy matematyki wyższej” oraz sprzężonego z tymi zajęciami wykładu ”Matematyczne podstawy modelowania komputerowego”
Literatura podstawowa:
(brak informacji)
Efekt modułowy Kody efektów kierunkowych do których odnosi się efekt modułowy [stopień realizacji: skala 1-5]
Posiada znajomość zaawansowanych metody modelowania w fizyce, chemii i biologii. [2BF_03_1]
 KBF_W03 [4/5] KBF_W08 [4/5] KBF_K04 [4/5]
zna podstawowe relacje matematyczne stosowane w modelowaniu molekularnym [2BF_03_2]
 KBF_W08 [4/5] KBF_U02 [4/5] KBF_U06 [4/5] KBF_K02 [4/5]
umie zastosować aparat modelowania matematycznego do rozwiązania złożonych problemów z fizyki i biofizyki [2BF_03_3]
 KBF_W08 [3/5] KBF_U02 [3/5] KBF_U06 [3/5] KBF_K02 [3/5]
potrafi korzystać z wybranych pakietów oprogramowania do analizy struktury molekularnej, białek, leków itp [2BF_03_4]
 KBF_W08 [3/5] KBF_U02 [3/5] KBF_U06 [3/5] KBF_K02 [3/5]
Posiada znajomość metod komputerowego modelowania przyrządów optycznych umożliwiających symulacje m. in. soczewek wewnątrzgałkowych [2BF_03_5]
 KBF_W08 [4/5] KBF_U02 [4/5] KBF_U06 [4/5] KBF_K02 [4/5]
umie zastosować aparat modelowania matematycznego do rozwiązania złożonych problemów z optyki [2BF_03_6]
 KBF_W08 [4/5] KBF_U02 [4/5] KBF_U06 [4/5] KBF_K02 [4/5]
potrafi korzystać z wybranych pakietów oprogramowania do analizy układów optycznych oka oraz dodatkowych soczewek [2BF_03_7]
 KBF_W08 [4/5] KBF_U02 [4/5] KBF_U06 [4/5] KBF_K02 [4/5]
Typ Opis Kody efektów modułowych do których odnosi się sposób weryfikacji
aktywność i zaliczenie przedmiotu [2BF_03_w_1]
Samodzielne modelowanie problemów rozwiązywanych w ramach laboratorium. Zaliczenie na podstawie oddanych projektów
 2BF_03_1 2BF_03_2 2BF_03_3 2BF_03_4 2BF_03_5 2BF_03_6 2BF_03_7
Rodzaj prowadzonych zajęć Praca własna studenta Sposoby weryfikacji
Typ Opis (z uwzględnieniem metod dydaktycznych) Liczba godzin Opis Liczba godzin
laboratorium [2BF_03_fs_1]
Rozwiązywanie konkretnych zagadnień modelowania komputerowego. Praca zarówno grupowa jak i indywidualna
 30
Praca grupowa nad zadaniami projektowymi, praca samodzielna,przygotowanie prezentacji wyników.
45 aktywność i zaliczenie przedmiotu [2BF_03_w_1]
Załączniki
Opis modułu (PDF)
Informacje o sylabusach mogą ulec zmianie w trakcie trwania studiów.
Sylabusy (USOSweb)
Semestr Moduł Język wykładowy
(brak danych)