Metody mikroskopowe w badaniach układów biologicznych Kierunek studiów: Biofizyka
Kod programu: W4-S1BF19.2020

Nazwa modułu: Metody mikroskopowe w badaniach układów biologicznych
Kod modułu: W4-1BF-20-12
Kod programu: W4-S1BF19.2020
Semestr:
  • semestr zimowy 2023/2024
  • semestr zimowy 2022/2023
  • semestr zimowy 2021/2022
Język wykładowy: polski
Forma zaliczenia: egzamin
Punkty ECTS: 5
Opis:
Program wykładu oraz materiał obowiązujący na konwersatoriach: Wykład obejmuje następujące zagadnienia: 1) Parametry charakteryzujące jakość obrazów mikroskopowych: rozdzielczość i kontrast. 2) Charakterystyka technik przygotowania próbek biologicznych: barwienie, odwadnianie, kriomrożenie. 3) Szczegółowy opis zjawisk luminescencji i ich wykorzystanie we fluorescencyjnej mikroskopii optycznej. 4) Mikroskopia dwufotonowa i SNOM. 5) Mikroskopia fluorescencyjna i jej techniki pomiarowe: STED, TIRFM, FRET, FRAP, FLIP, iFLIP. 6) Mikroskop sił atomowych – techniki skanowania (stałego i przerywanego kontaktu), spektroskopia siła i pomiar oddziaływań międzycząsteczkowych. 7) Skaningowy i transmisyjny mikroskop elektronowy w zastosowaniach do badań preparatów biologicznych. Kriomikroskop elektronowy. 8) Porównanie zalet i wad omówionych technik mikroskopowych. W ramach pracy w laboratorium studenci w sposób praktyczny: - z użyciem barwienia fluorescencyjnego przeprowadzi obserwacje przeżywalności komórek poddanych działaniu wybranej substancji o zastosowaniu medycznym, - dokona pomiarów topografii i elastyczności włókien kolagenowych, - przygotuje próbkę z materiału biologicznego i przeprowadzi rejestrację jej obrazów z użyciem elektronowego mikroskopu skaningowego (dla próbki wysuszonej i poddanej kriomrożeniu). - wzbogacą swoje umiejętności w posługiwaniu się oprogramowaniem Gwiddion służącym do opracowani i analizy obrazów mikroskopowych. Egzamin po 1 semestrze.
Wymagania wstępne:
Znajomość podstaw metod mikroskopowych uzyskana w trakcie zajęć Metody mikroskopowe (I rok, 1 semestr studiów).
Literatura podstawowa:
(brak informacji)
Efekt modułowy Kody efektów kierunkowych do których odnosi się efekt modułowy [stopień realizacji: skala 1-5]
Student posiada pogłębioną wiedzę na temat technik mikroskopii fluorescencyjnej. [1BF_12_1]
 KBF_W10 [5/5] KBF_W11 [5/5] KBF_U04 [5/5] KBF_U07 [5/5] KBF_U13 [5/5] KBF_K09 [5/5]
Student zna techniki pomiarowe mikroskopii sił atomowych używane w badaniach biologicznych. [1BF_12_2]
 KBF_W10 [4/5] KBF_W11 [4/5] KBF_U04 [4/5] KBF_U07 [4/5] KBF_U13 [4/5] KBF_K09 [4/5]
Student potrafi prawidłowo zaplanować pomiar i przygotować próbki do badań mikroskopowych. przygotować mikroskop do prowadzenia obserwacji i przeprowadzić pomiary. [1BF_12_3]
 KBF_W10 [4/5] KBF_W11 [4/5] KBF_U04 [4/5] KBF_U07 [4/5] KBF_U08 [4/5]
Student zna techniki pomiarowe mikroskopii elektronowej stosowane w obrazowaniu materiałów biologicznych. [1BF_12_4]
 KBF_W10 [4/5] KBF_W11 [4/5] KBF_U07 [4/5] KBF_U08 [4/5] KBF_U12 [4/5]
Student zna metody przygotowania preparatów biologicznych do obserwacji mikroskopowych. [1BF_12_5]
 KBF_W10 [3/5] KBF_W11 [3/5] KBF_U07 [3/5] KBF_U08 [3/5] KBF_U12 [3/5]
Student zna ograniczenia i możliwości obserwacji próbek biologicznych prowadzonych z użyciem różnych rodzajów mikroskopów (optycznych, elektronowych i ze skanującą sondą). [1BF_12_6]
 KBF_W10 [5/5] KBF_W11 [5/5] KBF_U07 [5/5] KBF_U08 [5/5] KBF_U12 [5/5]
Student potrafi rejestrować obrazy mikroskopowe i wyznaczać paramety: rozmiary obiektów, chropowatość, kierunek uporządkowania włókien itd., przy pomocy oprogramowania Gwyddion. [1BF_12_7]
 KBF_W10 [4/5] KBF_W11 [4/5] KBF_U07 [4/5] KBF_U18 [4/5] KBF_K04 [4/5] KBF_K09 [4/5]
Student potrafi pozyskiwać informacje z literatury i innych źródeł, potrafi integrować pozyskane informacje i dokonywać ich interpretacji, wyciągać wnioski oraz formułować i uzasadniać opinie na temat poznanych technik mikroskopowych. [1BF_12_8]
 KBF_W10 [4/5] KBF_U13 [4/5] KBF_U18 [4/5] KBF_K02 [4/5] KBF_K09 [4/5]
Typ Opis Kody efektów modułowych do których odnosi się sposób weryfikacji
kolokwium [1BF_12_w_1]
Przeprowadzone przed każdymi zajęciami laboratoryjnemu ustne sprawdzenie stopnia opanowania zadanego wcześniej materiału. Wykonanie trzech sprawozdania pisemnych z przeprowadzonych badań; skala ocen 2-5.
 1BF_12_1 1BF_12_2 1BF_12_3 1BF_12_4 1BF_12_5 1BF_12_6 1BF_12_7 1BF_12_8
aktywność na zajęciach [1BF_12_w_2]
Aktywny udział w dyskusjach w trakcie wykładu i w pracowniach podczas prowadzenia pomiarów; skala ocen 2-5
 1BF_12_1 1BF_12_2 1BF_12_3 1BF_12_4 1BF_12_5 1BF_12_6 1BF_12_7 1BF_12_8
egzamin pisemny lub ustny [1BF_12_w_3]
Warunkiem przystąpienia do egzaminu jest uzyskanie zaliczenia z konwersatorium. Zakres materiału – wszystkie zagadnienia teoretyczne omawiane na wykładach i w trakcie konwersatoriów; skala ocen 2-5.
 1BF_12_1 1BF_12_2 1BF_12_3 1BF_12_4 1BF_12_5 1BF_12_6 1BF_12_7 1BF_12_8
Rodzaj prowadzonych zajęć Praca własna studenta Sposoby weryfikacji
Typ Opis (z uwzględnieniem metod dydaktycznych) Liczba godzin Opis Liczba godzin
wykład [1BF_12_fs_1]
Wykład rozbudowuje pozyskaną wiedzę z zakresu technik mikroskopowych stosowanych zastosowania w biofizyce. Prowadzony jest z wykorzystaniem pomocy audiowizualnych. Treści wykładu będą przekazane studentom w formacie pdf.
 30
Praca z podręcznikiem i materiałami z wykładu oraz z literaturą uzupełniającą.
 30 aktywność na zajęciach [1BF_12_w_2] egzamin pisemny lub ustny [1BF_12_w_3]
laboratorium [1BF_12_fs_2]
Zajęcia laboratoryjne w specjalistycznych pracowniach badawczych.
 45
Student zobowiązany jest do zapoznania się wyznaczonymi zagadnieniami i instrukcjami umożliwiającymi przygotowanie do wykonywania pomiarów.
 30 kolokwium [1BF_12_w_1] aktywność na zajęciach [1BF_12_w_2]
Załączniki
Opis modułu (PDF)
Informacje o sylabusach mogą ulec zmianie w trakcie trwania studiów.
Sylabusy (USOSweb)
Semestr Moduł Język wykładowy
(brak danych)