Methods of imaging plant cells and tissues Field of study: Biology
Programme code: W2-S1BI19.2020

Module name: Methods of imaging plant cells and tissues
Module code: 1BL_81a
Programme code: W2-S1BI19.2020
Semester: winter semester 2022/2023
Language of instruction: Polish
Form of verification: course work
ECTS credits: 2
Description:
Metody obrazowania komórek in vivo i in vitro to intensywnie rozwijająca się dziedzina badawcza mająca zastosowanie w biologii, biotechnologii i medycynie. Umiejętności obrazowania komórek i tkanek to podstawa we współczesnej diagnostyce związanej zarówno z analizą podstawowych procesów zachodzących w komórkach, jak i ich reakcji na stres biotyczny jak i abiotyczny. W związku z tym idea tego przedmiotu zasadza się na omówieniu metod mikroskopowych (mikroskopia świetlna i elektronowa) w obrazowaniu komórek i tkanek roślinnych, jednak co najważniejsze na pozyskaniu przez studenta praktycznych umiejętności obrazowania komórek. Celem przedmiotu jest uzyskanie przez studenta: (1) praktycznych umiejętności wykonywania obrazowania komórek z wykorzystaniem mikroskopii fluorescencyjnej, w tym konfokalnej, (2) praktycznych umiejętności akwizycji obrazu w 3 wymiarach, (3) poznanie podstaw mikrodysekcji (izolacji wyciętego materiału, izolacja pojedynczych komórek lub fragmentów tkanek z preparatów trwałych, (4) przygotowanie materiału roślinnego do obserwacji w mikroskopie fluorescencyjnym i konfokalnym (w tym immunoznakowanie) (5) zastosowanie technik dekonwolucyjnych, (6) obrazowanie komórek w mikroskopie świetlnym, konfokalnym i elektronowym (7) morfometryczna analiza obrazu, (8) analiza ekspresji genów i białek, (9) nabycie kompetencji w zakresie samodzielnego wykonywania obrazowania komórek i interpretacji uzyskanych wyników.
Prerequisites:
Ogólna wiedza i umiejętności z zakresu nauk ścisłych i przyrodniczych.
Key reading:
jak w sylabusie.
Learning outcome of the module Codes of the learning outcomes of the programme to which the learning outcome of the module is related [level of competence: scale 1-5]
Ma wiedzę dotyczącą podstawowych praw fizyki i chemii niezbędnych dla zrozumienia procesów pozwalających na wizualizację komórek i tkanek roślinnych. [1BL_81_1]
 1BL_W02_P [4/5]
Zna i rozumie budowę i funkcjonowanie organizmów na każdym poziomie komórkowym i tkankowym oraz rozumie zależności i wpływ środowiska na funkcjonowanie roślin. [1BL_81_2]
 1BL_W03_P [4/5]
Zna i rozumie metodologię badań biologicznych doświadczalnych pozwalających na wizualizacje komórek roślinnych, w szczególności zaawansowanych metod mikroskopii konfokalnej i programów komputerowych. [1BL_81_3]
 1BL_W06_P [4/5]
Rozumie związki między osiągnięciami nauk przyrodniczych, w tym technik mikroskopowych a możliwościami ich wykorzystania w życiu społeczno-gospodarczym. [1BL_81_4]
 1BL_W07_P [5/5]
Potrafi stosować podstawowe techniki i narzędzia badawcze biologii doświadczalnej, w szczególności zaawansowanych technik mikroskopowych oraz metod pozwalających na obrazowanie komórek roślinnych. [1BL_81_5]
 1BL_U01_P [5/5]
Potrafi planować i wykonywać w laboratorium proste pomiary fizyczne, biologiczne i chemiczne oraz dokonywać odpowiednich obserwacji. [1BL_81_6]
 1BL_U03_P [5/5]
Potrafi pracować samodzielnej oraz komunikować się z grupą podczas pracy zespołowej. [1BL_81_7]
 1BL_U04_P [5/5]
Type Description Codes of the learning outcomes of the module to which assessment is related
zaliczenie na ocenę [1BL_81_w_1]
na zasadach określonych w sylabusie
 1BL_81_1 1BL_81_2 1BL_81_3 1BL_81_4 1BL_81_5 1BL_81_6 1BL_81_7
Form of teaching Student's own work Assessment of the learning outcomes
Type Description (including teaching methods) Number of hours Description Number of hours
laboratory classes [1BL_81_fs_1]
Praca pod kierunkiem prowadzącego – nabycie praktycznych umiejętności obrazowania komórek w mikroskopie fluorescencyjnym, w tym konfokalnym, analizy elektronogramów, wykonywania rekonstrukcji 3D, analizy wyników i ich interpretacji.
 30
Przygotowanie do laboratoriów na podstawie zalecanej przez prowadzącego literatury.
 20 zaliczenie na ocenę [1BL_81_w_1]
Attachments
Module description (PDF)
Information concerning module syllabuses might be changed during studies.
Syllabuses (USOSweb)
Semester Module Language of instruction
(no information given)