Molecular modelling Field of study: Chemistry
Programme code: 03-S2CHI15.2019

Module name: Molecular modelling
Module code: 0310-CH-S2-B-MM
Programme code: 03-S2CHI15.2019
Semester:
  • summer semester 2021/2022
  • summer semester 2020/2021
  • summer semester 2019/2020
Language of instruction: Polish
Form of verification: exam
ECTS credits: 2
Description:
Moduł modelowanie molekularne ma za zadanie zapoznanie studentów z podstawowymi koncepcjami i pojęciami chemoinformatyki w szczególności problemów reprezentacji obiektów molekularnych in silico, ich kodowania oraz przekształceń. Wprowadza studentów w problemy projektowania związków biologicznie aktywnych.
Prerequisites:
Znajomość pojęć matematyki wyższej (pochodnej, całki, prostych równań różniczkowych). Znajomość rachunku wektorowo-macierzowego.
Key reading:
(no information given)
Learning outcome of the module Codes of the learning outcomes of the programme to which the learning outcome of the module is related [level of competence: scale 1-5]
Zna podstawowe prawa mechaniki kwantowej i wyjaśnia strukturę elektronową atomów i cząsteczek. [0310-CH-S2-B-MM_1]
 CH_W01 [3/5]
Potrafi scharakteryzować i sklasyfikować oddziaływania międzycząsteczkowe. [0310-CH-S2-B-MM_2]
 CH_W01 [3/5]
Ma świadomość komplementarności badań teoretycznych i doświadczalnych i ich roli w poznawaniu struktury materii. [0310-CH-S2-B-MM_3]
 CH_K01 [3/5] CH_K02 [3/5]
Objaśnia powiązania chemoinformatyki z chemią organiczną oraz charakteryzuje metody projektowania związków biologicznie aktywnych z uwzględnieniem dokowania molekularnego. [0310-CH-S2-B-MM_4]
 CH_W06 [4/5]
Posługuje się dostępnymi chemoinformatycznymi bazami danych i różnymi systemami kodowania związków chemicznych. [0310-CH-S2-B-MM_5]
 CH_U01 [4/5]
Analizuje dane zawarte w różnych standardach wymiany molekularnej i generuje deskryptory molekularne i używa ich do modelowania QSAR i QSPR. [0310-CH-S2-B-MM_6]
 CH_U01 [4/5]
Opracowuje procedurę projektowania nowych leków. [0310-CH-S2-B-MM_7]
 CH_U01 [4/5]
Postępuje zgodnie z zasadami etyki pracy z wykorzystaniem zasobów internetowych. [0310-CH-S2-B-MM_8]
 CH_K01 [5/5] CH_K04 [4/5]
Type Description Codes of the learning outcomes of the module to which assessment is related
egzamin [0310-CH-S2-B-MM_w_1]
Egzamin pisemny weryfikujący wiedzę w oparciu o treści wykładów i ćwiczeń oraz wskazaną w sylabusie literaturę.
 0310-CH-S2-B-MM_1 0310-CH-S2-B-MM_2 0310-CH-S2-B-MM_3 0310-CH-S2-B-MM_4
kolokwium [0310-CH-S2-B-MM_w_2]
Sprawdzian pisemny weryfikujący wiedzę oraz umiejętności w rozwiązywaniu zadań i problemów z zakresu chemoinformatyki.
 0310-CH-S2-B-MM_5 0310-CH-S2-B-MM_6 0310-CH-S2-B-MM_7 0310-CH-S2-B-MM_8
sprawozdanie [0310-CH-S2-B-MM_w_3]
Ocena poprawności wykonania projektu.
 0310-CH-S2-B-MM_5 0310-CH-S2-B-MM_6 0310-CH-S2-B-MM_7 0310-CH-S2-B-MM_8
ocenianie ciągłe [0310-CH-S2-B-MM_w_4]
Ocena praktycznych umiejętności pracy w laboratorium.
 0310-CH-S2-B-MM_5 0310-CH-S2-B-MM_6 0310-CH-S2-B-MM_7 0310-CH-S2-B-MM_8
Form of teaching Student's own work Assessment of the learning outcomes
Type Description (including teaching methods) Number of hours Description Number of hours
lecture [0310-CH-S2-B-MM_fs_1]
Wykład omawiający podstawowe zagadnienia projektowania molekularnego.
 15
Praca ze wskazaną literaturą przedmiotu obejmująca samodzielne przyswojenie wiedzy odnośnie wskazanych zagadnień na wykładzie.
 10 egzamin [0310-CH-S2-B-MM_w_1]
laboratory classes [0310-CH-S2-B-MM_fs_2]
Ćwiczenia laboratoryjne obejmujące projekt obliczeniowy z zakresu chemoinformatyki i projektowania molekularnego.
 20
Przygotowanie teoretyczne do zajęć z tematów poruszanych na wykładzie. Rozwiązywanie zagadnień podanych przez prowadzącego.
 15 kolokwium [0310-CH-S2-B-MM_w_2] sprawozdanie [0310-CH-S2-B-MM_w_3] ocenianie ciągłe [0310-CH-S2-B-MM_w_4]
Attachments
Module description (PDF)
Information concerning module syllabuses might be changed during studies.
Syllabuses (USOSweb)
Semester Module Language of instruction
(no information given)