Modelowanie komputerowe Field of study: Biophysics
Programme code: 03-S2BF13.2017

Module name: Modelowanie komputerowe
Module code: 0305-2BF-17-03
Programme code: 03-S2BF13.2017
Semester:
  • summer semester 2018/2019
  • winter semester 2018/2019
  • summer semester 2017/2018
  • winter semester 2017/2018
Language of instruction: Polish
Form of verification: course work
ECTS credits: 4
Description:
1. Modelowanie deterministyczne za pomocą równań różniczkowych zwyczajnych - przykłady i zastosowania w biofizyce: - modelowanie transmisji impulsów nerwowych - modelowanie wzrostu guza nowotworowego - modelowanie motorów molekularnych - wykorzystanie baz danych białek i aminokwasów 2. Teoria funkcjonału gęstości - modelowanie molekuł organicznych (np. aminokwasów) oraz wyznaczanie przy użyciu teorii DFT parametrów, które później można użyć w metodach symulacji opartych o dynamikę molekularną 3. Modelowanie molekuł organicznych metodami dynamiki molekularnej 4. Modelowanie układu optycznego oka (soczewka, rogówka, ciało szkliste, ciecz wodnista) oraz wpływ ośrodków optycznych na obraz tworzony na siatkówce oka. 5. Modelowanie wpływu soczewek stosowanych przed okiem na obraz tworzony na siatkówce oka. 6. Modelowania układów optycznych w zakresie projektowania spersonalizowanej korekcji terapeutycznej (soczewek wewnątrzgałkowych), poprzez zastosowanie algorytmów obliczeniowych.
Prerequisites:
Wiedza z wykładów „Wybrane elementy matematyki wyższej” oraz sprzężonego z tymi zajęciami wykładu ”Matematyczne podstawy modelowania komputerowego”
Key reading:
(no information given)
Learning outcome of the module Codes of the learning outcomes of the programme to which the learning outcome of the module is related [level of competence: scale 1-5]
Posiada znajomość zaawansowanych metody modelowania w fizyce, chemii i biologii. [2BF_03_1]
 KBF_W03 [4/5] KBF_W08 [4/5] KBF_K04 [4/5]
zna podstawowe relacje matematyczne stosowane w modelowaniu molekularnym [2BF_03_2]
 KBF_W08 [4/5] KBF_U02 [4/5] KBF_U06 [4/5] KBF_K02 [4/5]
umie zastosować aparat modelowania matematycznego do rozwiązania złożonych problemów z fizyki i biofizyki [2BF_03_3]
 KBF_W08 [3/5] KBF_U02 [3/5] KBF_U06 [3/5] KBF_K02 [3/5]
potrafi korzystać z wybranych pakietów oprogramowania do analizy struktury molekularnej, białek, leków itp [2BF_03_4]
 KBF_W08 [3/5] KBF_U02 [3/5] KBF_U06 [3/5] KBF_K02 [3/5]
Posiada znajomość metod komputerowego modelowania przyrządów optycznych umożliwiających symulacje m. in. soczewek wewnątrzgałkowych [2BF_03_5]
 KBF_W08 [4/5] KBF_U02 [4/5] KBF_U06 [4/5] KBF_K02 [4/5]
umie zastosować aparat modelowania matematycznego do rozwiązania złożonych problemów z optyki [2BF_03_6]
 KBF_W08 [4/5] KBF_U02 [4/5] KBF_U06 [4/5] KBF_K02 [4/5]
potrafi korzystać z wybranych pakietów oprogramowania do analizy układów optycznych oka oraz dodatkowych soczewek [2BF_03_7]
 KBF_W08 [4/5] KBF_U02 [4/5] KBF_U06 [4/5] KBF_K02 [4/5]
Type Description Codes of the learning outcomes of the module to which assessment is related
aktywność i zaliczenie przedmiotu [2BF_03_w_1]
Samodzielne modelowanie problemów rozwiązywanych w ramach laboratorium. Zaliczenie na podstawie oddanych projektów
 2BF_03_1 2BF_03_2 2BF_03_3 2BF_03_4 2BF_03_5 2BF_03_6 2BF_03_7
Form of teaching Student's own work Assessment of the learning outcomes
Type Description (including teaching methods) Number of hours Description Number of hours
laboratory classes [2BF_03_fs_1]
Rozwiązywanie konkretnych zagadnień modelowania komputerowego. Praca zarówno grupowa jak i indywidualna
 30
Praca grupowa nad zadaniami projektowymi, praca samodzielna,przygotowanie prezentacji wyników.
45 aktywność i zaliczenie przedmiotu [2BF_03_w_1]
Attachments
Module description (PDF)
Information concerning module syllabuses might be changed during studies.
Syllabuses (USOSweb)
Semester Module Language of instruction
(no information given)