Oprogramowanie narzędziowe Kierunek studiów: Inżynieria biomedyczna
Kod programu: 08-S1IB12.2015

Nazwa modułu: Oprogramowanie narzędziowe
Kod modułu: 08-IBIMB-S1-ON
Kod programu: 08-S1IB12.2015
Semestr: semestr zimowy 2017/2018
Język wykładowy: polski
Forma zaliczenia: zaliczenie
Punkty ECTS: 4
Opis:
W trakcie zajęć studenci zapoznają się z dostępnym oprogramowaniem specjalistycznym. Są to zarówno narzędzia – oprogramowanie dostępne poprzez sieć (interfejs WWW) jak i narzędzia desktopowe – do pobrania i zainstalowania na komputerze. Bioinformatyka ze względu na swą interdyscyplinarność wymaga pewnych szczególnych narzędzi – począwszy od specjalizowanego edytora tekstowego (BioEdit), poprzez oprogramowanie wspomagające analizę danych – R-project, Bioconductor po narzędzia wspomagające wizualizację wyników – Advanced Pathway Painter, Cytoscape, matplotlib.
Wymagania wstępne:
Podstawowa obsługa komputera, instalacja i konfiguracja oprogramowania.
Literatura podstawowa:
(brak informacji)
Efekt modułowy Kody efektów kierunkowych do których odnosi się efekt modułowy [stopień realizacji: skala 1-5]
Zna podstawowe zagadnienia bioinformatyki i odpowiadające im problemy algorytmiczne i obliczeniowe [k_1]
 W09 [3/5]
Posiada wiedzę związaną z dostępnym, profilowanym oprogramowaniem, zarówno darmowym jak i komercyjnym [k_2]
 W11 [1/5]
Potrafi zidentyfikować potrzebne funkcje jakie ma spełniać oprogramowanie w przypadku konkretnego zadania (problemu do wykonania) [k_3]
 U11 [5/5]
Potrafi umiejętnie skorzystać z znanego sobie oprogramowania (lub potrafi je znaleźć) w celu rozwiązania postawionego problemu [k_4]
 U03 [4/5]
Potrafi określić zakres swoich kompetencji/umiejętności i zdecydować, czy jest w stanie sam podołać zadaniu, czy też czy będzie potrzebna pomoc specjalisty (np. programista). [k_5]
 U21 [3/5]
Potrafi sprecyzować wymagania dla funkcjonalności oprogramowania i przekazać je w zrozumiałej formie specjaliście. [k_6]
 U22 [3/5]
umiejętnie łączy teorię z praktyką podczas realizacji zadań i projektów [k_7]
 U23 [2/5]
rozumie pozatechniczne aspekty i skutki jego działalności inżyniera biomedycznego [k_8]
 K02 [1/5]
Typ Opis Kody efektów modułowych do których odnosi się sposób weryfikacji
aktywność na zajęciach [k_w_1]
Prowadzący zajęcia przygotowuje zadania do wykonania, odpowiadające sprecyzowanym zagadnieniom. Zadaniem studentów jest ich wykonanie w określonym czasie.
 k_1 k_2 k_3 k_4 k_5 k_6 k_7 k_8
Rodzaj prowadzonych zajęć Praca własna studenta Sposoby weryfikacji
Typ Opis (z uwzględnieniem metod dydaktycznych) Liczba godzin Opis Liczba godzin
laboratorium [k_fs_1]
wykonanie zadanych ćwiczeń odpowiadających specyficznym zadaniom pod nadzorem prowadzącego.
 30
Przygotowanie sprawozdań z laboratoriów.
 90 aktywność na zajęciach [k_w_1]
Załączniki
Opis modułu (PDF)
Informacje o sylabusach mogą ulec zmianie w trakcie trwania studiów.
Sylabusy (USOSweb)
Semestr Moduł Język wykładowy
(brak danych)