Podstawy bioinformatyki Kierunek studiów: Biotechnologia
Kod programu: W2-S1BT19.2023

Nazwa modułu: Podstawy bioinformatyki
Kod modułu: 1BT_23_41
Kod programu: W2-S1BT19.2023
Semestr:
  • semestr zimowy 2026/2027
  • semestr zimowy 2025/2026
Język wykładowy: w zależności od wyboru
Forma zaliczenia: zaliczenie
Punkty ECTS: 2
Cel i opis treści kształcenia:
Moduł ten oferuje studentom wprowadzenie do podstawowej wiedzy z zakresu bioinformatyki. Program kursu obejmuje omówienie kluczowych algorytmów służących do przyrównywania dwóch lub większej liczby sekwencji, podstawy analiz filogenetycznych, wprowadzenie do porównawczego modelowania trójwymiarowej struktury białka (również z wykorzystaniem narzędzi sztucznej inteligencji), a także metody przewidywania in silico wpływu mutacji na strukturę białka. Studenci zdobywają umiejętności pozyskiwania danych do analiz bioinformatycznych z publicznie dostępnych repozytoriów danych genomicznych. Moduł zapewnia zrozumienie technik i metod stosowanych w analizach bioinformatycznych oraz wprowadza do podstawowych algorytmów używanych w tych analizach. Praktyczne ćwiczenia skupiają się na analizie bioinformatycznej danych, umożliwiając studentom interpretację wyników i zrozumienie sposobów rozwiązywania problemów za pomocą modelowych organizmów zwierzęcych i roślinnych.
Lista modułów koniecznych do zaliczenia przed przystąpieniem do tego modułu (o ile to konieczne): nie dotyczy
Efekt modułowy Kody efektów kierunkowych do których odnosi się efekt modułowy [stopień realizacji: skala 1-5]
Klasyfikuje i stosuje techniki informatyczne i statystyczne wykorzystywane w analizach sekwencji DNA i białek [1BT_23_1]
 1BT_W07 [5/5] 1BT_U03 [4/5] 1BT_U05 [5/5] 1BT_U06 [5/5] 1BT_K01 [5/5] 1BT_K02 [5/5]
Dobiera adekwatne metody bioinformatyczne i statystyczne do opisu zjawisk oraz gromadzenia i analizy danych pochodzących z eksperymentów biologicznych [1BT_23_2]
 1BT_W07 [5/5] 1BT_U01 [5/5] 1BT_K03 [5/5]
Samodzielnie planuje i przeprowadza analizy bioinformatyczne związane z rozwiązywaniem problemów badawczych z zakresu biotechnologii i biologii [1BT_23_3]
 1BT_W07 [5/5] 1BT_U01 [5/5] 1BT_K02 [5/5] 1BT_K03 [5/5] 1BT_K05 [5/5]
Docenia wagę stosowania narzędzi bioinformatycznych i statystycznych przy opisie zjawisk i procesów zachodzących w przyrodzie oraz w rozwiązywaniu problemów badawczych z zakresu biotechnologii i biologii [1BT_23_4]
 1BT_W07 [5/5] 1BT_U06 [5/5] 1BT_K02 [4/5] 1BT_K05 [5/5]
Wykazuje kreatywność i samodzielność w analizach bioinformatycznych i ma nawyk aktualizowania wiedzy z zakresu przedmiotu [1BT_23_5]
 1BT_W07 [5/5] 1BT_U06 [5/5] 1BT_U07 [5/5] 1BT_K03 [5/5] 1BT_K05 [5/5]
Forma prowadzonych zajęć Liczba godzin Metody prowadzenia zajęć Sposób weryfikacji efektów uczenia się Efekty uczenia się
konwersatorium [1BT_23_41_K] 10 Objaśnienie/wyjaśnienie [a05] 
Wykład problemowy [b01] 
Wykład konwersatoryjny [b02] 
Metody aktywizujące: gry dydaktyczne [b03] 
Metody aktywizujące: dyskusja/debata [b04] 
Metody aktywizujące: studium przypadku [b07] 
Metody aktywizujące: flipped classroom [b09] 
Projekcja [c02] 
Prezentacja [c07]  		zaliczenie 1BT_23_1 1BT_23_2 1BT_23_3 1BT_23_4 1BT_23_5
laboratorium [1BT_23_41_L] 20 Objaśnienie/wyjaśnienie [a05] 
Metody aktywizujące: gry dydaktyczne [b03] 
Metody aktywizujące: dyskusja/debata [b04] 
Metody aktywizujące: studium przypadku [b07] 
Metody aktywizujące: flipped classroom [b09] 
Plakat/poster [c05] 
Prezentacja [c07] 
Praca z komputerem [d01] 
Praca z innym narzędziem dydaktycznym [d03] 
Rekonstrukcja/odtworzenie [d04] 
Ćwiczenie laboratoryjne/doświadczenie [e01] 
Projektowanie [e04] 
Symulacja [e07] 
Praktyka badawcza [e08] 
Autoedukacja [f01] 
Indywidualna praca z tekstem [f02] 
Praca koncepcyjna [f03]  		zaliczenie 1BT_23_1 1BT_23_2 1BT_23_3 1BT_23_4 1BT_23_5
Praca studenta poza udziałem w zajęciach obejmuje w szczególności:
Nazwa Kategoria Opis
Czytanie literatury / analiza materiałów źródłowych [a02] Przygotowanie do zajęć
czytanie literatury wskazanej w sylabusie; przegląd, porządkowanie, analiza i wybór materiałów źródłowych do wykorzystania w ramach zajęć
Zapoznanie się z zapisami sylabusa [b01] Konsultowanie programu i organizacji zajęć
przeglądanie zawartości sylabusa i zapoznanie się z treścią jego zapisów
Ustalanie etapów realizacji zadań przyczyniających się do weryfikacji efektów uczenia się [c01] Przygotowanie do weryfikacji efektów uczenia się
przygotowanie strategii realizacji zadania uwzględniającej podział treści, czynności i ich zakres, czas realizacji oraz/lub sposób pozyskania niezbędnych do jego wykonania materiałów i narzędzi, itp.
Realizacja indywidualnego lub grupowego zadania zaliczeniowego/egz./etapowego [c03] Przygotowanie do weryfikacji efektów uczenia się
zbiór czynności zmierzających do wykonania zadania zleconego do realizacji poza zajęciami, jako obligatoryjnego etapu/elementu weryfikacji przypisanych do tych zajęć efektów uczenia się
Załączniki
Opis modułu (PDF)
Informacje o sylabusach mogą ulec zmianie w trakcie trwania studiów.
Sylabusy (USOSweb)
Semestr Moduł Język wykładowy
(brak danych)