Biodiversity and molecular filogenetics Field of study: Biotechnology
Programme code: W2-S2BT19.2022

Module name: Biodiversity and molecular filogenetics
Module code: 2BT_02A
Programme code: W2-S2BT19.2022
Semester:
  • summer semester 2025/2026
  • summer semester 2024/2025
  • summer semester 2023/2024
  • summer semester 2022/2023
Language of instruction: Polish
Form of verification: course work
ECTS credits: 3
Description:
Celem modułu jest zaznajomienie studentów z teoretycznymi i praktycznymi zastosowaniami technik biologii molekularnej do badań bioróżnorodności oraz ewolucyjnych aspektów jej źródeł. W części konwersatoryjnej student zapozna się technikami badań molekularnych bioróżnorodności biologicznej oraz przedstawi prezentację podsumowującą wyniki uzyskane w trakcie części laboratoryjnej. W trakcie laboratorium student zapozna się z metodą izolacji DNA z materiału zwierzęcego, przygotowaniem reakcji PCR z wybranymi markerami mitochondrialnymi oraz metodami analiz filogenetycznych uzyskanych sekwencji zastosowanych markerów molekularnych a także z bazami danych o bioróżnorodności molekularnej. Dla specjalności Biotechnologia roślin jest to przedmiot fakultatywny. Dla specjalności Biotechnologia środowiska jest to przedmiot fakultatywny-dyplomowy.
Prerequisites:
Zrealizowane efekty kształcenia modułów: Bioróżnorodność, Mechanizmy ewolucji;
Key reading:
jak w sylabusie
Learning outcome of the module Codes of the learning outcomes of the programme to which the learning outcome of the module is related [level of competence: scale 1-5]
Student potrafi zidentyfikować gatunek zwierzęcia, z którego pochodzi próbka, na podstawie jego sekwencji barkodowej; [2BT_02_1]
 2BT_W03_P [5/5]
Student zna procedurę izolacji DNA z materiału zwierzęcego; zna programy stosowane do analizy sekwencji i badań filogenetycznych. [2BT_02_2]
 2BT_W04_P [5/5]
Student potrafi określić stopień pokrewieństwa między badanymi organizmami na podstawie sekwencji markerów molekularnych; [2BT_02_3]
 2BT_W01_P [5/5]
Potrafi dobrać marker mitochondrialny oraz warunki reakcji PCR do grupy zwierząt, która bada. [2BT_02_4]
 2BT_U02_P [5/5]
Potrafi korzystać z bazy NCBI w celu uzyskania danych koniecznych do analiz barkodowych i filogenetycznych. [2BT_02_5]
 2BT_U03_P [5/5]
Student planuje i wykonuje w terenie i laboratorium zaawansowane identyfikacje nieznanych mu gatunków zwierząt oraz wysnuwa wnioski o ich przynależności systematycznej i pokrewieństwie. [2BT_02_6]
 2BT_K01_P [5/5]
Zdaje sobie sprawę z ograniczeń metod biotechnologicznych obecnie stosowanych w badaniach różnorodności gatunkowej. [2BT_02_7]
 2BT_K01_P [5/5]
Dostrzega potrzebę doskonalenia narzędzi biotechnologicznych w celu określenia stopnia i identyfikacji zagrożeń bioróżnorodności na świecie. [2BT_02_8]
 2BT_K03_P [5/5]
Type Description Codes of the learning outcomes of the module to which assessment is related
Coursework [2BT_02_w_1]
according to the Syllabus
 2BT_02_1 2BT_02_2 2BT_02_3 2BT_02_4 2BT_02_5 2BT_02_6 2BT_02_7 2BT_02_8
Form of teaching Student's own work Assessment of the learning outcomes
Type Description (including teaching methods) Number of hours Description Number of hours
discussion classes [2BT_02_fs_1]
Konwersatorium obejmujące podstawy teoretyczne metod biologii molekularnej stosowanych w analizie bioróżnorodności oraz metod filogenetyki molekularnej.
 15
Praca z literaturą zalecaną w „sylabusie”. Samodzielne przygotowanie prezentacji w formie pliku komputerowego, oraz przygotowanie do wygłoszenia referatu na podstawie wyników uzyskanych w analizach laboratoryjnych.
 10 Coursework [2BT_02_w_1]
laboratory classes [2BT_02_fs_2]
- praca samodzielna i w grupie pod nadzorem prowadzącego zajęcia pracownika; - wykonywanie doświadczeń na przygotowanym materiale; - analiza i dyskusja osiągniętych wyników.
 30
Przygotowanie do laboratorium na podstawie zalecanej w „sylabusie” literatury.
 20 Coursework [2BT_02_w_1]
Attachments
Module description (PDF)
Information concerning module syllabuses might be changed during studies.
Syllabuses (USOSweb)
Semester Module Language of instruction
(no information given)