Computer Modeling Kierunek studiów: Biofizyka
Kod programu: W4-S2BFA21.2021

Nazwa modułu: Computer Modeling
Kod modułu: W4-2BF-MB-21-23
Kod programu: W4-S2BFA21.2021
Semestr: semestr zimowy 2022/2023
Język wykładowy: angielski
Forma zaliczenia: zaliczenie
Punkty ECTS: 4
Opis:
W trakcie zajęć studenci w praktyce zapoznają się z: 1. Modelowanie deterministyczne oparte na numerycznym rozwiązywaniu równań różniczkowych zwyczajnych - przykłady i zastosowania w biofizyce: - przekazywanie impulsów nerwowych, - wzrost guza, - motory molekularne; 2. Bazy aminokwasów i białek. 3. Modelowanie cząsteczek i ich układów metodami funkcjonału gęstości (DFT); parametry geometryczne, charakterystyki rozkładu ładunku i widma molekularne cząsteczek organicznych (np. aminokwasów). 4. Modelowanie cząsteczek organicznych i ich układów metodami dynamiki molekularnej.
Wymagania wstępne:
(brak informacji)
Literatura podstawowa:
(brak informacji)
Efekt modułowy Kody efektów kierunkowych do których odnosi się efekt modułowy [stopień realizacji: skala 1-5]
Posiada znajomość zaawansowanych metody modelowania w fizyce, chemii i biologii [MB_23_1]
 KBF_W03 [4/5] KBF_W08 [4/5] KBF_K04 [4/5]
Studenet zna podstawowe relacje matematyczne stosowane w modelowaniu molekularnym [MB_23_2]
 KBF_W08 [4/5] KBF_U02 [4/5] KBF_U06 [4/5] KBF_K02 [4/5]
Student umie zastosować aparat modelowania matematycznego do rozwiązania złożonych problemów z fizyki i biofizyki [MB_23_3]
 KBF_W08 [3/5] KBF_U02 [3/5] KBF_U06 [3/5] KBF_K02 [3/5]
Potrafi korzystać z wybranych pakietów oprogramowania do analizy struktury molekularnej, białek, leków itp. [MB_23_4]
 KBF_W08 [3/5] KBF_U02 [3/5] KBF_U06 [3/5] KBF_K02 [3/5]
Typ Opis Kody efektów modułowych do których odnosi się sposób weryfikacji
zaliczenie [MB_23_w_1]
średnia ocen z indywidualnie zrealizowanych projektów
 MB_23_1 MB_23_2 MB_23_3 MB_23_4
Rodzaj prowadzonych zajęć Praca własna studenta Sposoby weryfikacji
Typ Opis (z uwzględnieniem metod dydaktycznych) Liczba godzin Opis Liczba godzin
laboratorium [MB_23_fs_1]
Rozwiązywanie konkretnych zagadnień modelowania komputerowego. Praca zarówno grupowa jak i indywidualna
 30
Praca grupowa nad zadaniami projektowymi, praca samodzielna, przygotowanie prezentacji wyników
 45 zaliczenie [MB_23_w_1]
Załączniki
Opis modułu (PDF)
Informacje o sylabusach mogą ulec zmianie w trakcie trwania studiów.
Sylabusy (USOSweb)
Semestr Moduł Język wykładowy
(brak danych)