Plant genomics Field of study: Biology
Programme code: 01-S2BI12.2014

Module name: Plant genomics
Module code: 2BL_55
Programme code: 01-S2BI12.2014
Semester:
  • summer semester 2015/2016
  • winter semester 2015/2016
  • summer semester 2014/2015
  • winter semester 2014/2015
Language of instruction: Polish
Form of verification: course work
ECTS credits: 6
Description:
Moduł przekazuje specjalistyczną wiedzę z zakresu genomiki roślin. Zapoznaje studenta z budową genomów roślinnych i ich analizą od strony struktury, funkcji i regulacji ekspresji genów. Szczególny nacisk położony jest na strategie sekwencjonowania genomów oraz metody izolacji i badania ekspresji genów i białek u roślin a także regulacji ekspresji genów na drodze mechanizmów epigenetycznych. Student nabywa umiejętności sekwencjonowania DNA, analizy epigenomu, identyfikacji SNP metodą ecoTILLING oraz analizy ekspresji genów. Zajęcia laboratoryjne doskonalą także umiejętność analizy i interpretacji wyników doświadczeń, zarówno własnych, jak i opublikowanych w bieżących anglojęzycznych pracach naukowych.
Prerequisites:
wiedza i umiejętności z zakresu genetyki, analizy genetycznej i biologii molekularnej
Key reading:
jak "Literatura obowiązkowa" w sylabusie
Learning outcome of the module Codes of the learning outcomes of the programme to which the learning outcome of the module is related [level of competence: scale 1-5]
Posiada szczegółową wiedzę dotyczącą struktury i funkcji genomów roślin wyższych i sposoby jej wykorzystania w biotechnologii roślin. [2BL_55_1]
 2BL_W23 [5/5]
Rozumie zasady planowania eksperymentów z dziedziny genomiki. [2BL_55_2]
 2BL_W23 [5/5]
Zna podstawowe i zaawansowane techniki analizy genomu, epigenomu i transkryptomu. [2BL_55_3]
 2BL_W08 [5/5]
Potrafi zastosować metody analizy sekwencji genów i ich ekspresji do rozwiązania problemów badawczych. [2BL_55_4]
 2BL_W23 [5/5]
Umie analizować i krytycznie oceniać wyniki opublikowanych prac badawczych z dziedziny genomiki roślin. [2BL_55_5]
 2BL_W09 [5/5]
Zbiera dane empiryczne oraz potrafi wyciągać wnioski z przeprowadzanych samodzielnie doświadczeń oraz z doniesień naukowych. [2BL_55_6]
 2BL_U15 [5/5]
Ocenia zagrożenia wynikające ze stosowanych technik badawczych oraz przestrzega warunków bezpiecznej pracy. [2BL_55_7]
 2BL_U03 [5/5]
Ma nawyk korzystania z dostępnych źródeł informacji naukowej oraz posługiwania się zasadami krytycznego wnioskowania przy rozstrzyganiu praktycznych problemów. [2BL_55_8]
 2BL_U06 [5/5]
Type Description Codes of the learning outcomes of the module to which assessment is related
kolokwium [2BL_55_w_1]
Pisemne kolokwia sprawdzające wiedzę i umiejętności nabyte na zajęciach laboratoryjnych.
 2BL_55_1 2BL_55_2 2BL_55_3 2BL_55_4 2BL_55_8
sprawozdanie z laboratoriów [2BL_55_w_2]
Pisemne sprawozdanie weryfikujące umiejętność interpretacji wyników doświadczeń prowadzonych przez studenta samodzielnie oraz przykładowych danych literaturowych.
 2BL_55_5 2BL_55_6
ocena ciągła umiejętności praktycznych [2BL_55_w_3]
Umiejętności praktyczne oceniane na każdych zajęciach – ocena ciągła sprawności studenta w posługiwaniu się urządzeniami laboratoryjnymi, ocena jakości wykonanych eksperymentów i umiejętności interpretowania uzyskanych wyników.
 2BL_55_2 2BL_55_7 2BL_55_8
zaliczenie pisemne [2BL_55_w_4]
Zakres zaliczenia pisemnego – zagadnienia omawiane podczas wykładów; warunkiem przystąpienia do egzaminu jest zaliczenie zajęć laboratoryjnych.
 2BL_55_1 2BL_55_2 2BL_55_3 2BL_55_4
Form of teaching Student's own work Assessment of the learning outcomes
Type Description (including teaching methods) Number of hours Description Number of hours
lecture [2BL_55_fs_1]
wykład przedstawiający wybrane zagadnienia z wykorzystaniem pomocy audiowizualnych - prezentacje komputerowe ilustrujące omawiane zagadnienia
 15
praca z podręcznikiem, lektura uzupełniająca artykułów naukowych, w tym anglojęzycznych
 35 zaliczenie pisemne [2BL_55_w_4]
laboratory classes [2BL_55_fs_2]
Samodzielna praca w laboratorium biologii molekularnej, wykonywanie doświadczeń na podstawie instrukcji, analiza uzyskanych wyników. Przewidziane są godziny konsultacyjne dla dyskusji nad problemami wskazanymi przez studenta, wskazania piśmiennictwa i źródeł internetowych.
 45
Przygotowanie do zadań laboratoryjnych na podstawie zalecanej przez prowadzącego literatury przedmiotu, w tym anglojęzycznej.
 55 kolokwium [2BL_55_w_1] sprawozdanie z laboratoriów [2BL_55_w_2] ocena ciągła umiejętności praktycznych [2BL_55_w_3]
Attachments
Module description (PDF)
Information concerning module syllabuses might be changed during studies.
Syllabuses (USOSweb)
Semester Module Language of instruction
(no information given)