Metody mikroskopowe w badaniach układów biologicznych
Field of study: Biophysics
Programme code: W4-S1BF19.2020
Module name: | Metody mikroskopowe w badaniach układów biologicznych |
---|---|
Module code: | W4-1BF-20-12 |
Programme code: | W4-S1BF19.2020 |
Semester: |
|
Language of instruction: | Polish |
Form of verification: | exam |
ECTS credits: | 5 |
Description: | Program wykładu oraz materiał obowiązujący na konwersatoriach:
Wykład obejmuje następujące zagadnienia:
1) Parametry charakteryzujące jakość obrazów mikroskopowych: rozdzielczość i kontrast.
2) Charakterystyka technik przygotowania próbek biologicznych: barwienie, odwadnianie, kriomrożenie.
3) Szczegółowy opis zjawisk luminescencji i ich wykorzystanie we fluorescencyjnej mikroskopii optycznej.
4) Mikroskopia dwufotonowa i SNOM.
5) Mikroskopia fluorescencyjna i jej techniki pomiarowe: STED, TIRFM, FRET, FRAP, FLIP, iFLIP.
6) Mikroskop sił atomowych – techniki skanowania (stałego i przerywanego kontaktu), spektroskopia siła i pomiar oddziaływań międzycząsteczkowych.
7) Skaningowy i transmisyjny mikroskop elektronowy w zastosowaniach do badań preparatów biologicznych. Kriomikroskop elektronowy.
8) Porównanie zalet i wad omówionych technik mikroskopowych.
W ramach pracy w laboratorium studenci w sposób praktyczny:
- z użyciem barwienia fluorescencyjnego przeprowadzi obserwacje przeżywalności komórek poddanych działaniu wybranej substancji o zastosowaniu medycznym,
- dokona pomiarów topografii i elastyczności włókien kolagenowych,
- przygotuje próbkę z materiału biologicznego i przeprowadzi rejestrację jej obrazów z użyciem elektronowego mikroskopu skaningowego (dla próbki wysuszonej i poddanej kriomrożeniu).
- wzbogacą swoje umiejętności w posługiwaniu się oprogramowaniem Gwiddion służącym do opracowani i analizy obrazów mikroskopowych.
Egzamin po 1 semestrze. |
Prerequisites: | Znajomość podstaw metod mikroskopowych uzyskana w trakcie zajęć Metody mikroskopowe (I rok, 1 semestr studiów). |
Key reading: | (no information given) |
Learning outcome of the module | Codes of the learning outcomes of the programme to which the learning outcome of the module is related [level of competence: scale 1-5] |
---|---|
Student posiada pogłębioną wiedzę na temat technik mikroskopii fluorescencyjnej. [1BF_12_1] |
KBF_W10 [5/5] |
Student zna techniki pomiarowe mikroskopii sił atomowych używane w badaniach biologicznych. [1BF_12_2] |
KBF_W10 [4/5] |
Student potrafi prawidłowo zaplanować pomiar i przygotować próbki do badań mikroskopowych. przygotować mikroskop do prowadzenia obserwacji i przeprowadzić pomiary. [1BF_12_3] |
KBF_W10 [4/5] |
Student zna techniki pomiarowe mikroskopii elektronowej stosowane w obrazowaniu materiałów biologicznych. [1BF_12_4] |
KBF_W10 [4/5] |
Student zna metody przygotowania preparatów biologicznych do obserwacji mikroskopowych. [1BF_12_5] |
KBF_W10 [3/5] |
Student zna ograniczenia i możliwości obserwacji próbek biologicznych prowadzonych z użyciem różnych rodzajów mikroskopów (optycznych, elektronowych i ze skanującą sondą). [1BF_12_6] |
KBF_W10 [5/5] |
Student potrafi rejestrować obrazy mikroskopowe i wyznaczać paramety: rozmiary obiektów, chropowatość, kierunek uporządkowania włókien itd., przy pomocy oprogramowania Gwyddion. [1BF_12_7] |
KBF_W10 [4/5] |
Student potrafi pozyskiwać informacje z literatury i innych źródeł, potrafi integrować pozyskane informacje i dokonywać ich interpretacji, wyciągać wnioski oraz formułować i uzasadniać opinie na temat poznanych technik mikroskopowych. [1BF_12_8] |
KBF_W10 [4/5] |
Type | Description | Codes of the learning outcomes of the module to which assessment is related |
---|---|---|
kolokwium [1BF_12_w_1] | Przeprowadzone przed każdymi zajęciami laboratoryjnemu ustne sprawdzenie stopnia opanowania zadanego wcześniej materiału. Wykonanie trzech sprawozdania pisemnych z przeprowadzonych badań; skala ocen 2-5. |
1BF_12_1 |
aktywność na zajęciach [1BF_12_w_2] | Aktywny udział w dyskusjach w trakcie wykładu i w pracowniach podczas prowadzenia pomiarów; skala ocen 2-5 |
1BF_12_1 |
egzamin pisemny lub ustny [1BF_12_w_3] | Warunkiem przystąpienia do egzaminu jest uzyskanie zaliczenia z konwersatorium. Zakres materiału – wszystkie zagadnienia teoretyczne omawiane na wykładach i w trakcie konwersatoriów; skala ocen 2-5. |
1BF_12_1 |
Form of teaching | Student's own work | Assessment of the learning outcomes | |||
---|---|---|---|---|---|
Type | Description (including teaching methods) | Number of hours | Description | Number of hours | |
lecture [1BF_12_fs_1] | Wykład rozbudowuje pozyskaną wiedzę z zakresu technik mikroskopowych stosowanych zastosowania w biofizyce. Prowadzony jest z wykorzystaniem pomocy audiowizualnych. Treści wykładu będą przekazane studentom w formacie pdf. |
30 | Praca z podręcznikiem i materiałami z wykładu oraz z literaturą uzupełniającą. |
30 |
aktywność na zajęciach [1BF_12_w_2] |
laboratory classes [1BF_12_fs_2] | Zajęcia laboratoryjne w specjalistycznych pracowniach badawczych. |
45 | Student zobowiązany jest do zapoznania się wyznaczonymi zagadnieniami i instrukcjami umożliwiającymi przygotowanie do wykonywania pomiarów. |
30 |
kolokwium [1BF_12_w_1] |
Attachments |
---|
Module description (PDF) |
Information concerning module syllabuses might be changed during studies.
Syllabuses (USOSweb) | ||
---|---|---|
Semester | Module | Language of instruction |
(no information given) |