Bioinformatics Field of study: Biotechnology
Programme code: W2-S2BT19.2020

Module name: Bioinformatics
Module code: 2BT_11A
Programme code: W2-S2BT19.2020
Semester: winter semester 2020/2021
Language of instruction: Polish
Form of verification: course work
ECTS credits: 5
Description:
Moduł przekazuje specjalistyczną wiedzę z zakresu bioinformatyki, w stopniu który umożliwi przeprowadzenie podstawowych analiz z zakresu: wyszukiwania informacji biologicznych w bazach danych, porównywania sekwencji DNA i białek, identyfikacji elementów funkcjonalnych genomu i określania funkcji białek oraz badań filogenetycznych prowadzonych w oparciu o dostępne sekwencje. Szczególny nacisk położony jest na poznanie różnych metod stosowanych w analizach bioinformatycznych. W przeprowadzonych samodzielnie analizach student nabywa umiejętności wyszukiwania informacji w dostępnych bazach danych, gromadzenia informacji pochodzących z eksperymentów biologicznych oraz podstawowych analiz bioinformatycznych. Ponadto, studenci zapoznają się w metodami analizy danych pochodzących z wysokoprzepustowego sekwencjonowania następnej generacji (NGS). Przedmiot obligatoryjny.
Prerequisites:
Opanowanie wiadomości z zakresu podstaw informatyki, genetyki, biologii molekularnej oraz biochemii
Key reading:
jak w sylabusie
Learning outcome of the module Codes of the learning outcomes of the programme to which the learning outcome of the module is related [level of competence: scale 1-5]
Klasyfikuje i stosuje techniki informatyczne i statystyczne wykorzystywane w analizach sekwencji DNA i białek [2BT_11_1]
 2BT_W01_P [4/5]
Wykorzystuje techniki informatyczne i bioinformatyczne do zbierania oraz opisu danych pochodzących z eksperymentów sekwencjonowania DNA, cDNA oraz analizy sekwencji i struktury białek [2BT_11_2]
 2BT_W03_P [4/5]
Dostrzega i analizuje związki i zależności w przyrodzie oraz wykorzystuje tę wiedzę w analizach filogenetycznych i ocenie bioróżnorodności na podstawie sekwencji DNA i białek [2BT_11_3]
 2BT_W03_P [4/5]
Dobiera adekwatne metody bioinformatyczne i statystyczne do opisu zjawisk oraz gromadzenia i analizy danych pochodzących z eksperymentów biologicznych [2BT_11_4]
 2BT_W01_P [5/5]
Samodzielnie planuje i przeprowadza analizy bioinformatyczne związane z rozwiązywaniem problemów badawczych z zakresu biotechnologii i biologii [2BT_11_5]
 2BT_U01_P [5/5] 2BT_U02_P [5/5]
Docenia wagę stosowania narzędzi bioinformatycznych i statystycznych przy opisie zjawisk i procesów zachodzących w przyrodzie oraz w rozwiązywaniu problemów badawczych z zakresu biotechnologii i biologii [2BT_11_6]
 2BT_U03_P [4/5]
Wykazuje kreatywność i samodzielność w analizach bioinformatycznych i ma nawyk aktualizowania wiedzy z zakresu przedmiotu [2BT_11_7]
 2BT_K01_P [5/5] 2BT_K03_P [5/5]
Type Description Codes of the learning outcomes of the module to which assessment is related
Coursework [2BT_11_w_1]
according to the Syllabus
 2BT_11_1 2BT_11_2 2BT_11_3 2BT_11_4 2BT_11_5 2BT_11_6 2BT_11_7
Form of teaching Student's own work Assessment of the learning outcomes
Type Description (including teaching methods) Number of hours Description Number of hours
lecture [2BT_11_fs_1]
Wykład z wybranych zagadnień z wykorzystaniem pomocy audiowizualnych - prezentacje komputerowe ilustrujące omawiane zagadnienia.
 15
praca z podręcznikiem, lektura uzupełniająca
 30 Coursework [2BT_11_w_1]
laboratory classes [2BT_11_fs_2]
Praca pod nadzorem prowadzącego - wykonywanie analiz na podstawie instrukcji, analiza uzyskanych wyników Możliwość konsultacji: Dyskusja nad zagadnieniami zaproponowanymi przez studenta
 45
Przyswojenie wiedzy z wykładów, praca z podręcznikiem, lektura uzupełniająca
 45 Coursework [2BT_11_w_1]
Attachments
Module description (PDF)
Information concerning module syllabuses might be changed during studies.
Syllabuses (USOSweb)
Semester Module Language of instruction
(no information given)