Quantum chemistry and molecular modelling Field of study: Chemistry
Programme code: 03-S2CHI15.2014

Module name: Quantum chemistry and molecular modelling
Module code: 0310-CH-S2-B-062
Programme code: 03-S2CHI15.2014
Semester: summer semester 2014/2015
Language of instruction: Polish
Form of verification: exam
ECTS credits: 7
Description:
Moduł Chemia kwantowa i modelowanie molekularne ma za zadanie zapoznanie studentów z ważniejszymi pojęciami chemii teoretycznej, w szczególności wyrobienie umiejętności posługiwania się metodami chemii kwantowej, termodynamiki statystycznej oraz mechaniki i dynamiki molekularnej do określania struktury, charakterystyki spektralnej i właściwości związków chemicznych jak również opisu reakcji chemicznych na gruncie chemii teoretycznej. Zapoznaje studentów z podstawowymi koncepcjami i pojęciami chemoinformatyki w szczególności problemów reprezentacji obiektów molekularnych in silico, ich kodowania oraz przekształceń. Wprowadza studentów w problemy projektowania związków biologicznie aktywnych.
Prerequisites:
Znajomość pojęć matematyki wyższej (pochodnej, całki, prostych równań różniczkowych). Znajomość rachunku wektorowo-macierzowego
Key reading:
(no information given)
Learning outcome of the module Codes of the learning outcomes of the programme to which the learning outcome of the module is related [level of competence: scale 1-5]
Zna podstawowe prawa mechaniki kwantowej i wyjaśnia strukturę elektronową atomów i cząsteczek [0310-CH-S2-B-062_1]
 CH_W02 [3/5]
Objaśnia powiązania chemoinformatyki z chemią organiczną oraz charakteryzuje metody projektowania związków biologicznie aktywnych z uwzględnieniem dokowania molekularnego. [0310-CH-S2-B-062_10]
 CH_W08 [4/5] CH_W09 [5/5]
Posługuje się dostępnymi chemoinformatycznymi bazami danych i różnymi systemami kodowania związków chemicznych [0310-CH-S2-B-062_11]
 CH_U11 [4/5] CH_U12 [4/5]
Analizuje dane zawarte w różnych standardach wymiany molekularnej i generuje deskryptory molekularne i używa ich do modelowania QSAR i QSPR. [0310-CH-S2-B-062_12]
 CH_U12 [4/5] CH_U13 [3/5] CH_U14 [4/5]
Opracowuje procedurę projektowania nowych leków. [0310-CH-S2-B-062_13 ]
 CH_U05 [1/5] CH_U11 [4/5] CH_U12 [4/5] CH_U13 [3/5]
Postępuje zgodnie z zasadami etyki pracy z wykorzystaniem zasobów internetowych [0310-CH-S2-B-062_14]
 CH_K06 [4/5] CH_K08 [5/5]
Zna podstawy teoretyczne metod obliczeniowych w tym metod funkcji falowej, metody DFT i mechaniki molekularnej [0310-CH-S2-B-062_2]
 CH_W09 [5/5]
Zna elementy teorii grup w zakresie umożliwiającym opis i klasyfikację stanów kwantowych cząsteczek [0310-CH-S2-B-062_3]
 CH_W04 [4/5]
Zna pojęcie funkcji rozdziału i podstawowe pojęcia termodynamiki [0310-CH-S2-B-062_4]
 CH_W07 [3/5]
Potrafi opisać przebieg reakcji chemicznej na gruncie chemii kwantowej [0310-CH-S2-B-062_5]
 CH_W07 [3/5]
Potrafi scharakteryzować i sklasyfikować oddziaływania międzycząsteczkowe [0310-CH-S2-B-062_6]
 CH_W02 [3/5]
Umie zastosować metody chemii kwantowej, zawarte w dostępnych pakietach obliczeniowych, do badania struktury, reaktywności, oddziaływań międzycząsteczkowych i właściwości spektroskopowych związków chemicznych [0310-CH-S2-B-062_7]
 CH_U02 [3/5] CH_U07 [3/5] CH_U08 [5/5]
Umie wyznaczyć energię, entropię oraz potencjały termodynamiczne na poziomie molekularnym [0310-CH-S2-B-062_8]
 CH_U02 [3/5]
Ma świadomość komplementarności badań teoretycznych i doświadczalnych i ich roli w poznawaniu struktury materii [0310-CH-S2-B-062_9]
 CH_K09 [3/5] CH_K10 [3/5]
Type Description Codes of the learning outcomes of the module to which assessment is related
egzamin [0310-CH-S2-B-062_w_1]
Egzamin pisemny lub ustny (do wyboru przez studentów na pierwszym wykładzie) weryfikujący wiedzę w oparciu o treści wykładów i ćwiczeń oraz wskazaną w sylabusie literaturę
 0310-CH-S2-B-062_1 0310-CH-S2-B-062_10 0310-CH-S2-B-062_2 0310-CH-S2-B-062_3 0310-CH-S2-B-062_4 0310-CH-S2-B-062_5 0310-CH-S2-B-062_6
kolokwium pisemne [0310-CH-S2-B-062_w_2]
Sprawdzian pisemny weryfikujący wiedzę oraz umiejętności w rozwiązywaniu zadań i problemów z zakresu chemii teoretycznej
 0310-CH-S2-B-062_1 0310-CH-S2-B-062_12 0310-CH-S2-B-062_2 0310-CH-S2-B-062_3 0310-CH-S2-B-062_4 0310-CH-S2-B-062_6
sprawozdanie [0310-CH-S2-B-062_w_3]
Ocena poprawności wykonania projektu obliczeniowego
 0310-CH-S2-B-062_11 0310-CH-S2-B-062_12 0310-CH-S2-B-062_13 0310-CH-S2-B-062_14 0310-CH-S2-B-062_7 0310-CH-S2-B-062_8 0310-CH-S2-B-062_9
ocenianie ciągłe [0310-CH-S2-B-062_w_4]
Ocena praktycznych umiejętności pracy w laboratorium
 0310-CH-S2-B-062_11 0310-CH-S2-B-062_12 0310-CH-S2-B-062_13
Form of teaching Student's own work Assessment of the learning outcomes
Type Description (including teaching methods) Number of hours Description Number of hours
lecture [0310-CH-S2-B-062_fs_]
Wykład omawiający zagadnienia chemii teoretycznej z użyciem środków audiowizualnych Wykład omawiający podstawowe zagadnienia projektowania molekularnego
45
Praca ze wskazaną literaturą przedmiotu obejmująca samodzielne przyswojenie wiedzy odnośnie wskazanych zagadnień na wykładzie
 25 egzamin [0310-CH-S2-B-062_w_1]
laboratory classes [0310-CH-S2-B-062fs2]
Ćwiczenia laboratoryjne obejmujące obliczenia kwantowochemiczne Ćwiczenia laboratoryjne obejmujące projekt obliczeniowy z zakresu chemoinformatyki i projektowania molekularnego
60
Przygotowanie teoretyczne do zajęć z tematów poruszanych na wykładzie. Rozwiązywanie zagadnień podanych przez prowadzącego. Wykonanie obliczeń kwantowochemicznych .
 50 kolokwium pisemne [0310-CH-S2-B-062_w_2] sprawozdanie [0310-CH-S2-B-062_w_3] ocenianie ciągłe [0310-CH-S2-B-062_w_4]
Attachments
Module description (PDF)
Information concerning module syllabuses might be changed during studies.
Syllabuses (USOSweb)
Semester Module Language of instruction
(no information given)