Bioinformatics Field of study: Environmental Protection
Programme code: 01-S2MOS12.2017

Module name: Bioinformatics
Module code: 2OS_57
Programme code: 01-S2MOS12.2017
Semester:
  • summer semester 2018/2019
  • winter semester 2018/2019
  • summer semester 2017/2018
Language of instruction: Polish
Form of verification: course work
ECTS credits: 6
Description:
Moduł przekazuje specjalistyczną wiedzę z zakresu bioinformatyki, w stopniu który umożliwi przeprowadzenie podstawowych analiz z zakresu: wyszukiwania informacji biologicznych w bazach danych, porównywania sekwencji DNA i białek, identyfikacji elementów funkcjonalnych genomu i określania funkcji białek oraz badań filogenetycznych prowadzonych w oparciu o dostępne sekwencje. Szczególny nacisk położony jest na poznanie różnych metod stosowanych w analizach bioinformatycznych. W przeprowadzonych samodzielnie analizach student nabywa umiejętności wyszukiwania informacji w dostępnych bazach danych, gromadzenia informacji pochodzących z eksperymentów biologicznych oraz podstawowych analiz bioinformatycznych.
Prerequisites:
Opanowanie wiadomości z zakresu podstaw informatyki, genetyki, biologii molekularnej oraz biochemii.
Key reading:
jak "Literatura obowiązkowa" w sylabusie
Learning outcome of the module Codes of the learning outcomes of the programme to which the learning outcome of the module is related [level of competence: scale 1-5]
Klasyfikuje i stosuje techniki informatyczne i statystyczne wykorzystywane w analizach sekwencji DNA i białek. [2OS_57_1]
 2OS_W02 [4/5] 2OS_W06 [4/5]
Wykorzystuje techniki informatyczne i bioinformatyczne do zbierania oraz opisu danych pochodzących z eksperymentów sekwencjonowania DNA, cDNA oraz analizy sekwencji i struktury białek. [2OS_57_2]
 2OS_W14 [4/5] 2OS_W29 [4/5]
Dostrzega i analizuje związki i zależności w przyrodzie oraz wykorzystuje tę wiedzę w analizach filogenetycznych i ocenie bioróżnorodności na podstawie sekwencji DNA i białek. [2OS_57_3]
 2OS_W01 [4/5] 2OS_W30 [4/5]
Dobiera adekwatne metody bioinformatyczne i statystyczne do opisu zjawisk oraz gromadzenia i analizy danych pochodzących z eksperymentów biologicznych. [2OS_57_4]
 2OS_U01 [5/5] 2OS_U02 [4/5] 2OS_U03 [4/5]
Samodzielnie planuje i przeprowadza analizy bioinformatyczne związane z rozwiązywaniem problemów badawczych z zakresu ochrony środowiska, biologii i biotechnologii. [2OS_57_5]
 2OS_U24 [5/5] 2OS_U25 [5/5]
Docenia wagę stosowania narzędzi bioinformatycznych i statystycznych przy opisie zjawisk i procesów zachodzących w przyrodzie oraz w rozwiązywaniu problemów badawczych z zakresu biotechnologii i biologii. [2OS_57_6]
 2OS_K08 [4/5]
Wykazuje kreatywność i samodzielność w analizach bioinformatycznych i ma nawyk aktualizowania wiedzy z zakresu przedmiotu. [2OS_57_7]
 2OS_K13 [5/5] 2OS_K14 [5/5]
Type Description Codes of the learning outcomes of the module to which assessment is related
kolokwium zaliczeniowe [2OS_57_w_1]
Przeprowadzane samodzielnie, z wykorzystaniem komputera, analizy bioinformatyczne oraz zapis uzyskanych wyników w formie elektronicznej, sprawdzające stopień zrozumienia, opanowania wiadomości i umiejętności nabytych w trakcie zajęć.
 2OS_57_1 2OS_57_2 2OS_57_3 2OS_57_4 2OS_57_5
ocena ciągła umiejętności praktycznych [2OS_57_w_2]
Ocena przygotowania do zajęć i wiedzy z zakresu przedmiotu, ocena umiejętności przeprowadzenia analiz bioinformatycznych i wyciągania wniosków.
 2OS_57_4 2OS_57_5 2OS_57_6 2OS_57_7
sprawdzian praktyczny [2OS_57_w_3]
Ocena umiejętności samodzielnego przeprowadzenia analiz bioinformatycznych i wyciągania wniosków: przeprowadzane samodzielnie, z wykorzystaniem komputera, analizy bioinformatyczne oraz zapis uzyskanych wyników w formie elektronicznej.
 2OS_57_4 2OS_57_5 2OS_57_6 2OS_57_7
Form of teaching Student's own work Assessment of the learning outcomes
Type Description (including teaching methods) Number of hours Description Number of hours
lecture [2OS_57_fs_1]
Wykład z wybranych zagadnień z wykorzystaniem pomocy audiowizualnych - prezentacje komputerowe ilustrujące omawiane zagadnienia.
 15
praca z podręcznikiem, lektura uzupełniająca
 35 kolokwium zaliczeniowe [2OS_57_w_1]
laboratory classes [2OS_57_fs_2]
Praca pod nadzorem prowadzącego - wykonywanie analiz na podstawie instrukcji, analiza uzyskanych wyników. Możliwość konsultacji dla dyskusji nad zagadnieniami zaproponowanymi przez studenta.
 45
Przyswojenie wiedzy z wykładów, praca z podręcznikiem, lektura uzupełniająca.
 30 kolokwium zaliczeniowe [2OS_57_w_1] ocena ciągła umiejętności praktycznych [2OS_57_w_2] sprawdzian praktyczny [2OS_57_w_3]
Attachments
Module description (PDF)
Information concerning module syllabuses might be changed during studies.
Syllabuses (USOSweb)
Semester Module Language of instruction
(no information given)