Oprogramowanie narzędziowe Field of study: Biomedical Engineering
Programme code: 08-S1IB12.2016

Module name: Oprogramowanie narzędziowe
Module code: 08-IBIMB-S1-ON
Programme code: 08-S1IB12.2016
Semester: winter semester 2018/2019
Language of instruction: Polish
Form of verification: course work
ECTS credits: 4
Description:
W trakcie zajęć studenci zapoznają się z dostępnym oprogramowaniem specjalistycznym. Są to zarówno narzędzia – oprogramowanie dostępne poprzez sieć (interfejs WWW) jak i narzędzia desktopowe – do pobrania i zainstalowania na komputerze. Bioinformatyka ze względu na swą interdyscyplinarność wymaga pewnych szczególnych narzędzi – począwszy od specjalizowanego edytora tekstowego (BioEdit), poprzez oprogramowanie wspomagające analizę danych – R-project, Bioconductor po narzędzia wspomagające wizualizację wyników – Advanced Pathway Painter, Cytoscape, matplotlib.
Prerequisites:
Podstawowa obsługa komputera, instalacja i konfiguracja oprogramowania.
Key reading:
(no information given)
Learning outcome of the module Codes of the learning outcomes of the programme to which the learning outcome of the module is related [level of competence: scale 1-5]
Zna podstawowe zagadnienia bioinformatyki i odpowiadające im problemy algorytmiczne i obliczeniowe [k_1]
 W09 [3/5]
Posiada wiedzę związaną z dostępnym, profilowanym oprogramowaniem, zarówno darmowym jak i komercyjnym [k_2]
 W11 [1/5]
Potrafi zidentyfikować potrzebne funkcje jakie ma spełniać oprogramowanie w przypadku konkretnego zadania (problemu do wykonania) [k_3]
 U11 [5/5]
Potrafi umiejętnie skorzystać z znanego sobie oprogramowania (lub potrafi je znaleźć) w celu rozwiązania postawionego problemu [k_4]
 U03 [4/5]
Potrafi określić zakres swoich kompetencji/umiejętności i zdecydować, czy jest w stanie sam podołać zadaniu, czy też czy będzie potrzebna pomoc specjalisty (np. programista). [k_5]
 U21 [3/5]
Potrafi sprecyzować wymagania dla funkcjonalności oprogramowania i przekazać je w zrozumiałej formie specjaliście. [k_6]
 U22 [3/5]
umiejętnie łączy teorię z praktyką podczas realizacji zadań i projektów [k_7]
 U23 [2/5]
rozumie pozatechniczne aspekty i skutki jego działalności inżyniera biomedycznego [k_8]
 K02 [1/5]
Type Description Codes of the learning outcomes of the module to which assessment is related
aktywność na zajęciach [k_w_1]
Prowadzący zajęcia przygotowuje zadania do wykonania, odpowiadające sprecyzowanym zagadnieniom. Zadaniem studentów jest ich wykonanie w określonym czasie.
 k_1 k_2 k_3 k_4 k_5 k_6 k_7 k_8
Form of teaching Student's own work Assessment of the learning outcomes
Type Description (including teaching methods) Number of hours Description Number of hours
laboratory classes [k_fs_1]
wykonanie zadanych ćwiczeń odpowiadających specyficznym zadaniom pod nadzorem prowadzącego.
 30
Przygotowanie sprawozdań z laboratoriów.
 90 aktywność na zajęciach [k_w_1]
Attachments
Module description (PDF)
Information concerning module syllabuses might be changed during studies.
Syllabuses (USOSweb)
Semester Module Language of instruction
(no information given)