Metody i techniki w biotechnologii molekularnej Field of study: Biomedical Engineering
Programme code: 08-S1IB12.2016

Module name: Metody i techniki w biotechnologii molekularnej
Module code: 08-IBIMB-S1-MiTwBM
Programme code: 08-S1IB12.2016
Semester: winter semester 2018/2019
Language of instruction: Polish
Form of verification: course work
ECTS credits: 3
Description:
Przebieg zajęć laboratoryjnych obejmuje następujące doświadczenia i procedury: 1. Izolacja DNA metodą micro C-TAB 2. Metody określania stężenia i czystości wyizolowanych kwasów nukleinowych – NanoDrop 3. PCR- jako metoda specyficznej amplifikacji kwasów nukleinowych 4. Systemy elektroforezy kwasów nukleinowych – elektroforeza produktów amplifikacji PCR 5. Izolacja RNA z różnych organów siewek jęczmienia i określanie stężenia i czystości izolatów; Reakcja odwrotnej transkrypcji 6. Rekcja RT-PCR dla genu ulegającego zróżnicowanej przestrzennie ekspresji, elektroforeza produktów amplifikacji
Prerequisites:
Zapoznanie z podstawowymi zagadnieniami dotyczącymi biologii komórki oraz biologii molekularnej
Key reading:
(no information given)
Learning outcome of the module Codes of the learning outcomes of the programme to which the learning outcome of the module is related [level of competence: scale 1-5]
Definicja Biologii molekularnej jako interdyscyplinarnej dziedziny nauki. Zasady funkcjonowania organizmów żywych. Postawy metabolizmu na poziomie komórkowym. Przepływ informacji genetycznej. Budowa komórki pro- i eukariotycznej. Struktura i metabolizm komórek roślinnych i zwierzęcych – charakterystyka i funkcja organelli komórkowych. DNA jako nośnik informacji genetycznej – budowa DNA oraz struktura chromatyny. Replikacja DNA. Mitoza i mejoza – chromosomowe i molekularne podstawy dziedziczenia. Struktura genomów pro- i eukariotycznych. Struktura genu oraz sekwencji regulatorowych. Przebieg procesu transkrypcji i rodzaje RNA. Kod genetyczny, struktura rybosomów i proces translacji. [k_1]
 W05 [5/5]
Izolacja DNA roślinnego metodą mikro C-TAB, określenie stężenia i czystości wyizolowanego DNA z zastosowanie spektrofotometru Nano Drop ND-1000. Zastosowanie enzymów restrykcyjnych jako narzędzi biologii molekularnej – traktowanie enzymami restrykcyjnymi DNA faga lambda oraz wyizolowanego DNA genomowego jęczmienia (Hordeum vulgare), zapoznanie z metodami elektroforezy kwasów nukleinowych w żelach agarozowych i akrylamidowych, opis i porównanie uzyskanych wyników cięcia restrykcyjnego. Zastosowanie techniki PCR (Polymerase Chain Reaction) jako metody selektywnego namnażania określonych fragmentów genomu, analiza uzyskanych wyników po elektroforezie agarozowej. Izolacja RNA z liści i korzeni siedmiodniowych siewek jęczmienia z zastosowaniem odczynnika TriPure, określenie koncentracji i czystości wyizolowanego RNA z zastosowanie spektrofotometru Nano Drop ND-1000. Przeprowadzenie reakcji odwrotnej transkrypcji z zastosowaniem zestawu RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit (Fermentas) na bazie wyizolowanych RNA. Przeprowadzenie reakcji RT-PCR z zastosowaniem starterów dla genu HvEXPB1, ulegającego zróżnicowanej ekspresji wyłącznie w korzeniach jęczmienia – analiza wyników reakcji po elektroforezie agarozowej. [k_2]
 U01 [4/5]
przestrzega zasad etyki zawodowej [k_3]
 K04 [5/5]
przestrzega zasad bezpieczeństwa pracy [k_4]
 K07 [2/5]
Type Description Codes of the learning outcomes of the module to which assessment is related
kolokwia [k_w_1]
sprawdzające wiedzę i umiejętności dotyczące treści prezentowanych na poszczególnych zajęciach
 k_1 k_2 k_3 k_4
Form of teaching Student's own work Assessment of the learning outcomes
Type Description (including teaching methods) Number of hours Description Number of hours
lecture [k_fs_1]
Omówienie zagadnień związanych z tematyką zajęć
 15
Praca z literaturą
 15 kolokwia [k_w_1]
laboratory classes [k_fs_2]
Student otrzymuje instrukcje do wykonania projektu
 30
Wykonywanie projektu
 30 kolokwia [k_w_1]
Attachments
Module description (PDF)
Information concerning module syllabuses might be changed during studies.
Syllabuses (USOSweb)
Semester Module Language of instruction
(no information given)