Chemia kwantowa Field of study: Biophysics
Programme code: 03-S1BF12.2014

Na wykładzie student zapoznaje się z następującymi zagadnieniami: • Podstawy teoretyczne metod obliczeniowych chemii kwantowej. Metody oparte na przybliżeniu jednoelektronowym: metoda SCF w wariancie ab initio i półempirycznym. Efekty korelacyjne. Metody wychodzące poza przybliżenie jednoelektronowe: metoda perturbacyjna MP2, metoda mieszania konfiguracji i metoda sprzężonych klasterów. • Metody oparte na funkcji gęstości - metoda DFT. Równania Kohna - Shama. Metoda DFT oparta na równaniu zależnym od czasu (TDDFT) – widma elektronowe. Metody półempiryczne AM1 i PM3. • Zastosowanie metody DFT i metod półempirycznych do wyznaczania geometrii równowagowej i optymalnej konformacji cząsteczek o znaczeniu biologicznym. Zastosowanie metod kwantowochemicznych do wyznaczania widm molekularnych cząsteczek: widma elektrono-we, oscylacyjne oraz rezonansu magnetycznego. • Oddziaływanie międzycząsteczkowe, przybliżenie supermolekularne, błędy superpozycji bazy. Kwantowochemiczny opis wiązania wodorowego oraz wiązania z przeniesieniem ładunku. • Podstawy mechaniki molekularnej. Cząsteczki w temperaturach różnych od zera bezwzględnego. Elementy dynamiki molekularnej, generowanie możliwych konformacji ustalanie sta-bilnej konformacji makrocząsteczek. • Zastosowanie metod mechaniki molekularnej i chemii kwantowej do opisu procesów i własności przydatnych w projektowaniu leków: molekularne potencjały elektrostatyczne, ładunki cząstkowe, orbitale graniczne, dysocjacja wiązań na zajęciach laboratoryjnych student: • uczy się korzystania z pakietów obliczeniowych chemii teoretycznej i ich stosowania do rozwiązywania problemów chemicznych • wyznacza właściwości molekularne metodami chemii obliczeniowej • przygotowuje sprawozdania zawierające opis, analizę i wnioski dotyczące otrzymanych wyników w ramach pracy własnej student : • w oparciu o notatki z wykładów oraz literaturę uzupełniającą dąży do utrwalenia pozyskanej wiedzy • doskonali umiejętności niezbędne do rozwiązywania zadań i problemów z chemii metodami teoretycznymi • podejmuje próbę rozwiązania zadań i problemów zaproponowanych przez prowadzącego na wykładzie Egzamin obowiązkowy

zna podstawowe pojęcia i twierdzenia z wybranych działów matematyki wyższej posiada podstawową wiedzę z poszczególnych działów chemii obejmującą: chemię nieorganiczną, organiczną i elementy chemii fizycznej

(no information given)